MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 2131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
2	NC_011246	CAA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
3	NC_011246	AAAC	2	8	96	103	75 %	0 %	0 %	25 %	203288273
4	NC_011246	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
5	NC_011246	ATTAGA	2	12	150	161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288273
6	NC_011246	AAG	2	6	173	178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
7	NC_011246	A	6	6	193	198	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
8	NC_011246	AAG	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
9	NC_011246	CAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
10	NC_011246	A	7	7	243	249	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
11	NC_011246	AAG	2	6	251	256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
12	NC_011246	AAAAAG	2	12	278	289	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203288273
13	NC_011246	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
14	NC_011246	A	7	7	345	351	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
15	NC_011246	AAG	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
16	NC_011246	AAG	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
17	NC_011246	A	6	6	392	397	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
18	NC_011246	A	7	7	399	405	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
19	NC_011246	TTAGAG	2	12	409	420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288273
20	NC_011246	AAT	2	6	441	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288273
21	NC_011246	AGA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
22	NC_011246	A	6	6	458	463	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
23	NC_011246	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
24	NC_011246	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288273
25	NC_011246	AAG	4	12	497	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
26	NC_011246	AGA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
27	NC_011246	ATA	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288273
28	NC_011246	AGA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
29	NC_011246	AGA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
30	NC_011246	ACAG	2	8	570	577	50 %	0 %	25 %	25 %	203288273
31	NC_011246	GAA	3	9	583	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
32	NC_011246	A	6	6	590	595	100 %	0 %	0 %	0 %	203288273
33	NC_011246	ACA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
34	NC_011246	CAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
35	NC_011246	GAA	3	9	613	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
36	NC_011246	ATT	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288273
37	NC_011246	GAG	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288273
38	NC_011246	A	8	8	690	697	100 %	0 %	0 %	0 %	203288274
39	NC_011246	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
40	NC_011246	TGAA	2	8	779	786	50 %	25 %	25 %	0 %	203288274
41	NC_011246	TAG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
42	NC_011246	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
43	NC_011246	ACA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
44	NC_011246	CCT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288274
45	NC_011246	TGC	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288274
46	NC_011246	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
47	NC_011246	AT	3	6	1003	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
48	NC_011246	ATT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
49	NC_011246	AT	3	6	1033	1038	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
50	NC_011246	TAT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
51	NC_011246	A	7	7	1096	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	203288274
52	NC_011246	TA	3	6	1136	1141	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
53	NC_011246	GAT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
54	NC_011246	AT	4	8	1190	1197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
55	NC_011246	CAA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
56	NC_011246	AGA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288274
57	NC_011246	AT	3	6	1269	1274	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
58	NC_011246	AAATA	2	10	1296	1305	80 %	20 %	0 %	0 %	203288274
59	NC_011246	AGA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288274
60	NC_011246	ATG	3	9	1391	1399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
61	NC_011246	CAA	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
62	NC_011246	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
63	NC_011246	AAT	2	6	1464	1469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
64	NC_011246	ATG	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
65	NC_011246	TAT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
66	NC_011246	GAA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
67	NC_011246	AAAG	2	8	2049	2056	75 %	0 %	25 %	0 %	203288275
68	NC_011246	ATA	3	9	2080	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
69	NC_011246	GAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
70	NC_011246	TTG	2	6	2106	2111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288275
71	NC_011246	CAA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288275
72	NC_011246	TAG	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
73	NC_011246	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
74	NC_011246	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
75	NC_011246	TA	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
76	NC_011246	ATGA	2	8	2283	2290	50 %	25 %	25 %	0 %	203288275
77	NC_011246	AAG	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
78	NC_011246	A	6	6	2324	2329	100 %	0 %	0 %	0 %	203288275
79	NC_011246	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	203288275
80	NC_011246	ATT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
81	NC_011246	GAT	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
82	NC_011246	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
83	NC_011246	TAG	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
84	NC_011246	TAAT	2	8	2419	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
85	NC_011246	A	7	7	2461	2467	100 %	0 %	0 %	0 %	203288275
86	NC_011246	AG	3	6	2523	2528	50 %	0 %	50 %	0 %	203288275
87	NC_011246	AT	3	6	2546	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
88	NC_011246	ATA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
89	NC_011246	AAT	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
90	NC_011246	TGAA	2	8	2656	2663	50 %	25 %	25 %	0 %	203288275
91	NC_011246	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	203288275
92	NC_011246	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
93	NC_011246	TAA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
94	NC_011246	GTA	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
95	NC_011246	AT	4	8	2823	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
96	NC_011246	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288275
97	NC_011246	AAC	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288275
98	NC_011246	ATT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
99	NC_011246	CTT	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288275
100	NC_011246	T	7	7	3206	3212	0 %	100 %	0 %	0 %	203288276
101	NC_011246	TTC	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288276
102	NC_011246	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288276
103	NC_011246	TAT	2	6	3272	3277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288276
104	NC_011246	T	6	6	3321	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	203288276
105	NC_011246	TA	3	6	3335	3340	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
106	NC_011246	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
107	NC_011246	CAAA	2	8	3533	3540	75 %	0 %	0 %	25 %	203288276
108	NC_011246	TGG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288276
109	NC_011246	TAG	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288276
110	NC_011246	AT	4	8	3633	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
111	NC_011246	TA	3	6	3653	3658	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
112	NC_011246	CTT	2	6	3689	3694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288276
113	NC_011246	ATTTA	2	10	3723	3732	40 %	60 %	0 %	0 %	203288276
114	NC_011246	CTTTA	2	10	3765	3774	20 %	60 %	0 %	20 %	203288276
115	NC_011246	AAAT	2	8	3783	3790	75 %	25 %	0 %	0 %	203288276
116	NC_011246	AT	3	6	3805	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
117	NC_011246	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288276
118	NC_011246	T	7	7	4052	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	203288277
119	NC_011246	ATT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
120	NC_011246	CA	3	6	4115	4120	50 %	0 %	0 %	50 %	203288277
121	NC_011246	TAC	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
122	NC_011246	TCTA	2	8	4196	4203	25 %	50 %	0 %	25 %	203288277
123	NC_011246	TGC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288277
124	NC_011246	TAT	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
125	NC_011246	TAA	2	6	4309	4314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288277
126	NC_011246	ACT	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
127	NC_011246	AATTA	2	10	4343	4352	60 %	40 %	0 %	0 %	203288277
128	NC_011246	TAC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
129	NC_011246	AAC	2	6	4436	4441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288277
130	NC_011246	TAG	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288277
131	NC_011246	TCA	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
132	NC_011246	TA	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	203288277
133	NC_011246	T	7	7	4689	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	203288277
134	NC_011246	TAA	2	6	4730	4735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288277
135	NC_011246	A	6	6	4734	4739	100 %	0 %	0 %	0 %	203288277
136	NC_011246	ATT	3	9	4742	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
137	NC_011246	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
138	NC_011246	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288278
139	NC_011246	TTG	2	6	5251	5256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288278
140	NC_011246	ATA	2	6	5501	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
141	NC_011246	TTC	2	6	5566	5571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288278
142	NC_011246	T	6	6	5604	5609	0 %	100 %	0 %	0 %	203288278
143	NC_011246	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288278
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148	NC_011246	ACC	3	9	5884	5892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288278
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160	NC_011246	TAA	2	6	6497	6502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
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164	NC_011246	TAA	2	6	6824	6829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
165	NC_011246	ATT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288279
166	NC_011246	TA	3	6	6848	6853	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
167	NC_011246	ATT	2	6	6888	6893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288279
168	NC_011246	AT	3	6	6896	6901	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
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172	NC_011246	TCT	3	9	6997	7005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288279
173	NC_011246	CTT	3	9	7019	7027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288279
174	NC_011246	TGT	2	6	7131	7136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288279
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255	NC_011246	AT	3	6	14637	14642	50 %	50 %	0 %	0 %	203288283
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257	NC_011246	GCA	2	6	14715	14720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288283
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262	NC_011246	ATAGTA	2	12	14950	14961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288283
263	NC_011246	ATC	2	6	15599	15604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288284
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265	NC_011246	CAT	2	6	15814	15819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288284
266	NC_011246	TTA	2	6	15820	15825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288284
267	NC_011246	T	6	6	15826	15831	0 %	100 %	0 %	0 %	203288284
268	NC_011246	ATC	2	6	15869	15874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288284
269	NC_011246	ATC	2	6	15876	15881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288284
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271	NC_011246	T	7	7	15889	15895	0 %	100 %	0 %	0 %	203288284
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400	NC_011246	ATC	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288289
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402	NC_011246	GCCTTG	2	12	25681	25692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288289
403	NC_011246	AGC	2	6	25729	25734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288289
404	NC_011246	C	6	6	25739	25744	0 %	0 %	0 %	100 %	203288289
405	NC_011246	TTA	2	6	25745	25750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288289
406	NC_011246	CTCTTA	2	12	25751	25762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288289
407	NC_011246	CAC	2	6	25788	25793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288289
408	NC_011246	ATC	2	6	25826	25831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288289
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422	NC_011246	AAT	2	6	26451	26456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288290
423	NC_011246	AAT	2	6	26519	26524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288290
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433	NC_011246	AAAT	2	8	26840	26847	75 %	25 %	0 %	0 %	203288290
434	NC_011246	AT	3	6	26872	26877	50 %	50 %	0 %	0 %	203288290
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444	NC_011246	ATT	2	6	27308	27313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288291
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488	NC_011246	ACA	2	6	28822	28827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288293
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500	NC_011246	A	6	6	29166	29171	100 %	0 %	0 %	0 %	203288293

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